چنانچه آنفلوانزای مرغی یك بیمار ایدزی را مبتلا كند می‌تواند به راحتی جهش یافته و به یك بیماری جهانگیر تبدیل شود.دكتر "رابرت وبستر" این امكان را مطرح كرد نوع مرگبار ویروس اچ ‪ ۵‬ان‪ ۱‬می‌تواند در بدن مبتلایان به ایدز كه دستگاه ایمنی آنها ضعیف شده است پنهان شود.این امر بطور بالقوه فرصت سازگاری بهتر ویروس را با بدن انسان فراهم می‌آورد و در نتیجه خطرناكتر خواهد شد.در حال حاضر ویروس اچ‪ ۵‬ان‪ ۱‬نمی‌تواند به راحتی از انسانی به انسان دیگر منتقل شود. این ویروس تاكنون ‪ ۱۲۵‬تن را در جنوب شرق آسیا آلوده كرده است، اما بیشتر این افراد در تماس مستقیم با پرندگان آلوده به آنفلوانزای مرغی بوده‌اند. كارشناسان در مورد شیوع این بیماری در پرندگان در این منطقه از جهان ابراز نگرانی كرده‌اند. اختلاط نزدیك پرندگان و انسانها می‌تواند به ظهور انواع مرگبارتر این ویروس بیانجامد.دكتر وبستر از بیمارستان تحقیقاتی كودكان سنت جود در ممفیس می‌گوید كلید این مسئله زمانی است كه ویروس اچ ‪ ۵‬ان‪ ۱‬به شرق آفریقا برسد كه بیماری ایدز شایع است.تجربه بیماران سرطانی كه دستگاه ایمنی ضعیف شده است نشان می‌دهد این افراد نمی‌توانند ویروس آنفلوانزای معمولی را از بدن خود بیرون برانند و ویروس می‌تواند تا هفته‌ها به تكثیر بپردازد.همین مسئله نیز در مورد بیماران ایدزی كه به ویروس اچ ‪ ۵‬ان‪ ۱‬آلوده می‌شوند انتظار می‌رود.تكثیر این ویروس در یك دوره طولانی در بدن انسان شرایط مطلوبی برای ظهور انواع عفونی‌تر این ویروس فراهم می‌كند.ویروس اچ ‪ ۵‬ان‪ ۱‬هنوز به شرق آفریقا نرسیده است. اما اینجا مقصد نهایی بسیاری از پرندگانی است كه از مناطق آلوده به آنفلوانزای مرغی مهاجرت می‌كنند.كارشناسان سازمان كشاورزی و خواروبار ملل متحد فائو پیش بینی كرده‌اند این پرندگان بزودی به این مناطق برسند.از آنجایی كه شرایط اجتماعی و شیوه‌های مرغداری در آفریقا شبیه آسیاست این ویروس می‌تواند در بین طیور همانند ویتنام، تایلند، اندونزی و چین گسترش یابد.لوری گارت كارشناس بهداشتی می‌گوید با توجه به شیوع گسترده مالاریا، سل، و ایدز در آفریقا تشخیص علایم آنفلوانزای مرغی دشوار است. وضع نامناسب نظام بهداشتی در این قاره نیز شرایط را بدتر می‌كند.درحال حاضر پیش بینی تاثیر مستقیم ویروس اچ ‪ ۵‬ان‪ ۱‬در مبتلایان به ایدز دشوار است. با ضعف دستگاه ایمنی بدن بیمار به راحتی در اثر ازپای درمی‌آید.همه‌گیری آنفلوانزای مرغی می‌تواند جمعیت انبوه مبتلایان به ایدز را به كام مرگ بكشاند.