مطالب مجلد دوم از مجموعهی 'رسائل الشجره الالهیه' که به زبان عربی نگاشته شده مربوط به علوم طبیعی است. کتاب با این موضوعات تدوین گردیده است: امور عامه برای تمام اجسام، اجرای علوی و سفلی بسیط، استحاله درکیف مزاج، آثار علوی و سفلی، چگونگی ترکیب معادن، نفس حیوانی، نفس گیاهی، و نفس ناطقه.